El 27 de mayo de 2001 debutó con el equipo en el Estadio Vicente Calderón ante el CD Leganés con una victoria por uno a cero. Desde la temporada 2017-18 a la 2019-20 el equipo ha obtenido las tres peores clasificaciones del club en toda su historia. En la temporada 2020-21, los resultados mejoran y el club logra una de las tres plazas disponibles para la nueva liga Segunda División RFEF.